馬尾港（又稱馬江）系淡水良港，位于福州東南、閩江兩分流——臺江、烏龍江會合處，水路西至福州16.4公里，東距閩江口26.6公里。港內水域狹長，兩江會合處寬約4000米，航道寬600～1000米，金牌門最窄處僅350米，面積34平方公里。水深一般3米以上，錨地及航道水深多在7米以上，有大嶼、中沙、內攔江沙三處水深3米左右的淺灘，6000噸以上艦船須候潮進出。羅星塔、亭江、琯頭、壺江錨地可泊1萬噸級艦船，營前錨地可泊5000噸級艦船。羅星塔碼頭有1萬噸級和5000噸級泊位各2個，其余各處碼頭泊位在2000噸級以下。
馬尾附近群山擁抱，沿江而下，兩岸峰巒夾峙，有閩安、琯頭、長門、五虎為鎖鑰；閩江口有瑯岐、粗蘆、川石等島嶼為屏障，地勢險要，交通方便，陸路有專線鐵路與外(洋)福(州)線連接，通往全國各地，兩岸有公路與104、324國道公路銜接；水路海輪可達世界各港口，百噸汽輪常年可通往南平。
馬尾港為福州門戶，古代從海上進攻福州均由此溯江而上直抵城下，歷來為兵家防守要地。民國時期以馬尾為軍港，先后設閩口要港司令部、馬尾要港司令部，下轄閩口要塞各炮臺、魚雷臺，常駐艦艇和陸戰隊。中華人民共和國成立后作為商港和駐閩海軍的錨地，駐有護衛艇部隊。